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微生物藻類的細胞內含有葉綠素，能進行光合作用，制造自己生長所需要的營養物質，是光合作用的自養生物。藻類生長的三要素是空氣、水和陽光，三者缺一就會抑制藻類生長，其中以光的影響尤為重要。藻類根據其所處的環境，則有“著生”和“浮游”之別，“著生”即附著在其他物體上生長;“浮游”者則一般都是微小且絕大多數是肉眼看不見的藻類。藻類細胞都有明顯的細胞壁，在細胞壁內即為原生質，除藍藻外都具有明顯的細胞核。藍藻的繁殖則完全靠細胞分裂，亦有少數會形成孢子，所以也稱它為“裂殖藻”。

藻類存在于土壤和水體中，常隨空氣和補充水帶入冷卻水系統，循環冷卻水系統中的溫度、pH值和營養源非常適宜藻類的生長，而冷卻塔的配水池和塔壁正好是藻類生存繁殖的一個良好的環境。下表是冷卻水系統常見到的一些藻類，以及它們生長所需的溫度和pH值。

藻的種類

 綠藻 ： 小球藻、普通單細胞絲狀的絲藻 ；

 藍綠藻(含藍色素層) ：微囊藻、單細胞黏液型絲狀的顫藻、席藻 ；

 硅藻(細胞內含有棕色色素及二氧化硅) ：脆桿硅藻、細長連續的小環硅藻、成輪形等片硅藻、大的矩形或圓錐形等片硅藻

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